7. února roku 2020

Tím, že Anders Gunderson a Liana Woskie, HGHI

V ohnisku, na otázku, jak rychle nový patogen se šíří z jednoho případu pro mnohé je zásadní kus puzzle, vědci se snaží dát dohromady. K zodpovězení této otázky odborníci používají modely, které poskytují odhady, čerpající z různých zdrojů informací. Výsledkem tohoto složitého procesu modelování je základní reprodukční číslo neboli R0, které nám v průměru říká, kolik lidí může infikovaná osoba nakazit.

Co je R-nic?
R-nic (R0) je hodnota, kterou lze vypočítat pro přenosné nemoci. To představuje v průměru počet lidí, že jediný nakažený člověk, lze očekávat, že k přenosu této nákazy. Jinými slovy, jedná se o výpočet průměrné „rozšiřitelnosti“ infekčního onemocnění.

proč je to užitečné?
R0 poskytuje cenný vhled do potenciálu šíření onemocnění, které místní, státní a národní vlády, stejně jako orgány ochrany veřejného zdraví mohou použít, aby faktor v jejich rozhodování, aby co nejlépe ovládat . Také, protože to může být vypočtena pro různé nemoci, to nám umožňuje zasazení ohniska s těmi, co jsme viděli dříve, jako je například SARS, MERS, Ebola, AIDS, sezónní chřipka, 2009 H1N1 pandemie chřipky atd.

Jak se vypočítá?
Pro výpočet R0 se používají tři hlavní faktory. Jedná se o infekční období onemocnění, způsob přenosu a rychlost kontaktu. Do každého se ponoříme trochu hlouběji.

infekční období
Toto je doba, po kterou je infikovaná osoba schopna přenést tuto infekci na jiného člověka-jak dlouho je osoba s onemocněním nakažlivá. Delší infekční období znamenají vyšší hodnoty R0.

způsob přenosu
takto se nemoc šíří. Vzdušné infekce, jako je chřipka, se budou šířit rychleji než ty, které vyžadují přenos fyzického kontaktu, jako je HIV nebo Ebola. Infekce ve vzduchu proto mají tendenci mít vyšší hodnoty R0.

míra kontaktu
To se týká toho, s kolika lidmi lze očekávat, že osoba s onemocněním přijde do styku. Tato proměnná není specifická pro onemocnění, jako jsou první dvě. Spíše je ovlivněna řadou faktorů, včetně umístění a zavedených opatření v oblasti veřejného zdraví, jako jsou karantény nebo zákazy cestování. Tento faktor je značně modifikovatelný.

Zdroje Nejistoty v R0 v roce 2019-nCoV Vypuknutí

Infekční Období
Tato proměnná je poměrně pevná pro danou infekci — ale to může poněkud lišit od člověka k člověku. Například mladší, jinak zdravá osoba může být infekční po kratší dobu než starší osoba se základními zdravotními podmínkami. V případě 2019-nCoV máme odhady pro infekční období založené na počátečních případech, ale tyto hodnoty zůstávají odhady. To také uvádí, že R0 je průměr, a hodnoty, z nichž se vypočítává, včetně infekční období, jsou také průměry, což znamená, že může být značná variabilita. Například, pokud existují superspreadery s vysokou R0, bude to kompenzováno tím, že většina populace má skutečně nízkou R0.

Režim Přenosu.
Tato proměnná je také relativně stanovené pro danou infekci, ale podobně jako infekční období, nejsme jisti, jak přesně 2019-nCoV je šířit. Několik dřívější studie naznačují, že velké vzdušných kapének, jako to, co by mohlo být vyrobeno z kašel z infikované osoby, mohou přenášet choroby, ale tam byl zmatek o tom, zda lidé s 2019-nCoV jsou infekční před rozvojem příznaků. Například článek publikovaný v New England Journal of Medicine 30. Ledna, který dokumentoval důkazy o asymptomatickém přenosu 2019-nCoV, byl nyní údajně založen na chybných informacích. Stále se o tomto viru učíme a jakékoli dosud vytvořené hodnoty R0 lze vypočítat pouze na základě dostupných informací.

kontaktní frekvence
zde se věci začínají trochu komplikovat. Kontakt, rychlost infikovaného pacienta může značně lišit od člověka k člověku a závisí na mnoha proměnných, včetně geografie, cestování vzory, karantény nebo zákaz cestování, a schopnost zdravotnického systému efektivně identifikovat a izolovat infikované pacienty, aby jméno pár. Tato hodnota je na rozdíl od infekčního období nebo způsobu přenosu vysoce modifikovatelná. Vyšší míra kontaktu znamená vyšší hodnoty R0,ale všechny tyto faktory je třeba odhadnout na základě kontextu ohniska. V případě 2019-nCoV, nedávná studie v časopise The Lancet odhaduje každodenní cestování objemy a tvořily veřejné zdravotní zásahy, jako je karanténa, produkovat jejich odhady.

R0 roku 2019-nCoV v Kontextu

R0 je často v grafu vedle onemocnění je úmrtnost, jako v tomto NYT interaktivní (scroll dolů), nebo to vizualizace. To je užitečný způsob, jak získat představu jak o „šíření“ nemoci, tak o tom, jak je smrtelná ve srovnání s ostatními, ale není to bez problémů. V této fázi nelze míru úmrtnosti 2019-nCoV přesně vypočítat, protože neznáme skutečný počet celkových případů-jedná se tedy o odhad založený na tom, co víme nyní, podobně jako R0. Takže, tyto grafy poskytují některé souvislosti, kde 2019-nCoV stojí ve srovnání s jinými infekčními chorobami, ale měli bychom si uvědomit, že prostě vidět, že do roku 2019-nCoV nezdá být tak fatální, nebo roztíratelné, neznamená, že realitu vypuknutí bude hrát na to, že způsob,.

Co to všechno znamená?
to zdůrazňuje inherentní složitost a variabilitu ohnisek. Hodnoty R0 mohou být užitečné při měření závažnosti ohniska, ale vysoká hodnota R0 nezaručuje celosvětové šíření nebo pandemii. Jedná se o výpočet průměrné hodnoty, která je založena na odhadech průměrů. Když se vytvoří časné hodnoty R0, měly by být rozeslány s péčí a pokyny, jak je interpretovat. S tímto současným ohniskem jsme viděli veřejný poplach kolem odhadů R0, což je přesně to, čemu bychom se měli vyhnout.