すべての手術と同様に、HoLEP procedureにはリスクと副作用がないわけではありません。 最も一般的な副作用は、一時的な軽度の燃焼、排尿の頻度、および緊急性である。 ウォルシュ博士は、必要に応じて、または感染が発生した場合に抗生物質を処方することができます。 時折、男性は尿失禁を経験し、これは通常6週間以内に解決し、骨盤底の練習（手術前に教えられた）で改善することができます。 必要に応じてパッドを着用することができますが、3ヶ月後のパッドの必要性はまれです（この手順を受ける患者の2％未満）。

一部の患者は、一時的な腫脹のために処置後に尿を通過することができず、腫脹が解消され、膀胱が正常な機能を回復するまでカテーテルを必要とす この一時的なカテーテルは、通常、手術後わずか一日で正常に除去されます。 上記のように、間欠的な出血は、処置後数週間続くことができる。 まれに、患者は再入院を必要とするかもしれない血塊の尿、厳しい出血、または道を渡す突然の難しさを経験するかもしれません。 非常にまれに、前立腺の再生、持続的な失禁、膀胱内の保持された組織断片、および/または膀胱の穿孔が発生した場合、反復治療または追加の手術を行う

患者が弱い、またはまれに勃起を経験することは可能ですが、前立腺の除去は、手順の前に正常な勃起をしている場合、勃起能力に悪影響を及ぼ 前立腺の外科の後で、精液がぼうこうに戻って移動しがちであるので人がもはやオルガスムの間に精液を射精できないことは共通です。 この変更は不快または有害ではありませんが、将来的に父親の子供たちに希望する場合は、不妊治療に大きな影響を与える可能性があります。 ほとんどの男性は、オルガスムが楽しいことを続けていると報告しています。