Misiunea San Francisco de Solano marchează sfârșitul traseului misiunii. Această douăzeci și una și ultima misiune a fost fondată la 4 iulie 1823 în ceea ce este astăzi orașul Sonoma. Când părinții franciscani au ridicat această misiune cea mai nordică, a culminat trei sute de ani de așezare spaniol-mexicană în California, care datează din 1523. Misiunea San Francisco Solano a fost singura misiune fondată după independența Mexicului față de Spania și singura misiune fondată fără aprobarea prealabilă a Bisericii.

Misiunea Solano a fost copilul creierului părintelui jos Inktimira Altimira, care în timp ce lucra la misiunea din apropiere San Francisco De As Inkts, a devenit nemulțumit și a decis să-și înceapă propria misiune. După ce a primit permisiunea de la Guvernatorul din California Don Luis Arguello, a fost creat un plan pentru a închide Misiunea San Francisco De As Centixs și San Rafael și pentru a transfera bunuri și indieni de misiune în noul complex de misiuni de la Solano. În timp ce construiau Misiunea Solano, muncitorii au rămas la aceste barăci din lemn, așteptând ca Misiunea Permanentă să fie construită din chirpici. Cu toate acestea, clădirea a fost oprită temporar printr-un ordin al părintelui Presidente de Sarria, deoarece mulți din eparhie au simțit că epoca misiunii se apropie de sfârșit. Lucrările au fost apoi lăsate să fie terminate în misiune atunci când s-a convenit ca Mission San Francisco De As Circuss și Mission San Rafael să nu fie închise.

Misiunea Solano este situată vizavi de cazarma militară Sonoma, construită în 1836 de generalul Vallejo. Aici a fost ridicat primul steag de urs peste California la 14 iulie 1846, proclamând California republică în timp ce declara independența față de Mexic.biserica de la Mission Solano a fost construită în 1841 pentru a înlocui structura originală care se prăbușise. Lipsa banilor i-a împiedicat pe părinți să creeze această biserică misionară în modul elaborat cu care erau obișnuiți în Europa. Ochiul de deasupra altarului este denumit” ochiul cerului”, despre care părinții au spus că i-a permis lui Dumnezeu să vegheze asupra Bisericii. În interiorul bisericii se află un portret al acestui sfânt patron al misiunilor, Francis Solano, misionar al misiunilor peruviene.

cutremurul din 1906 a distrus misiunea, doar pentru a o vedea restaurată prin eforturile dedicate ale unor grupuri precum liga reperelor istorice. Moștenirea misiunilor din California trăiește într-o misiune Solano, așa cum se întâmplă în restul acestui lanț istoric.