Sannin eli legendaarisen kolmen Ninjan oppilaat olivat Kolmannen Hokagen, Hiruzen Sarutobin oppilaita. He ovat Jiraiya, Tsunade ja Orochimaru. Kaikki kolme ovat uskomattoman lahjakkaita shinobeja, jotka kunnostautuivat monin tavoin toisen Shinobien maailmansodan aikana. He saivat nimensä Hanzōsta, Amegakuren johtajasta, äärimmäisen voimakkaasta shinobista, jonka sanotaan olevan ikoni koko shinobien maailmassa. Vaikka hän päihitti heidät taistelussa, hän oli vaikuttunut heidän suorituksestaan ja nimitti heidät sellaisiksi säästäen samalla heidän henkensä uskoen, että sota lopulta päättyisi, kuten se päättyikin, Konohan voittoon.

Jiraiya – Pervo Rupikonnan tietäjä, oli Minato Namikazen opettaja, mies josta tulisi lopulta neljäs Hokage ja Naruto Uzumaki, Minaton poika ja seitsemäs Hokage. Hän oli tunnettu rupikonnan kutsumuksistaan taistelussa, mistä hän sai lempinimensä.

Tsunade – Etanaprinsessa, tunnetaan maailman vahvimpana ja kauneimpana naisena sekä suurimpana lääkärinä-nininä, jonka lempinimi tulee hänen etana-kutsumuksistaan. Oltuaan kaksi vuosikymmentä eläkkeellä hän palautti Konohan viidentenä hokagena opettajansa kuoleman jälkeen.

Orochimaru – valkoinen Psykokäärme loikkasi lopulta kylästä, kun hän jäi kiinni suorittamasta kokeita kanssaihmisillään shinobeilla ja jopa lapsilla. Hänet hylättiin Hokagen tehtävästä, koska Hiruzen suhtautui epäluuloisesti hänen aikeisiinsa. Loikattuaan kylästä hän liittyi Akatsukiin ja sai Uchiha Itachin ojentamat kädet takapuolelleen hyökätessään riivaamaan jälkimmäisen ruumiin.. Käärmekutsunsa ansiosta hän sai lempinimensä.