Mission San Francisco de Solano merkitsee mission Trailin päättymistä. Tämä kahdeskymmenesensimmäinen ja viimeinen lähetysasema perustettiin 4. heinäkuuta 1823 nykyiseen Sonoman kaupunkiin. Kun Fransiskaanisäät pystyttivät tämän pohjoisimman lähetysaseman, se huipentui kolmesataa vuotta kestäneeseen espanjalais-meksikolaiseen asuttamiseen Kaliforniassa, joka ajoittui vuoteen 1523. Mission San Francisco Solano oli ainoa missio, joka perustettiin Meksikon itsenäistyttyä Espanjasta, ja ainoa missio, joka perustettiin ilman kirkon ennakkohyväksyntää.

Mission Solano oli isä José Altimiran aivolapsi, joka työskennellessään läheisellä Mission San Francisco de Asísilla tuli tyytymättömäksi ja päätti aloittaa oman tehtävänsä. Saatuaan luvan California Govenor Don Luis Arguello, suunnitelma luotiin sulkea Mission San Francisco de Asís ja San Rafael, ja siirtää tavaroita ja mission intiaanit uuteen mission complex Solano. Mission Solanoa rakentaessaan työläiset jäivät näihin puuparakkeihin odottamaan, että pysyvä missio rakennettaisiin savitiilestä. Rakentaminen kuitenkin keskeytettiin väliaikaisesti Isä Presidente de Sarrian määräyksestä, sillä monet hiippakunnassa kokivat lähetysajan lähestyvän loppuaan. Tämän jälkeen lähetystyön sallittiin päättyä, kun sovittiin, että Mission San Francisco de Asísia ja Mission San Rafaelia ei suljettaisi.

Mission Solano sijaitsee vastapäätä Sonoman sotilasparakkeja, jotka kenraali Vallejo rakennutti vuonna 1836. Siellä ensimmäinen karhulippu nostettiin Kalifornian ylle 14. heinäkuuta 1846 julistaen Kalifornian tasavallaksi samalla kun se julistautui itsenäiseksi Meksikosta.

Mission Solanon kirkko rakennettiin vuonna 1841 korvaamaan alkuperäinen sortunut rakennelma. Rahapula esti isiä perustamasta tätä lähetyskirkkoa sillä taidokkaalla tavalla, johon he olivat tottuneet Euroopassa. Alttarin yläpuolella olevaa silmää kutsutaan ”taivaan silmäksi”, jonka isät sanoivat sallineen Jumalan pitää kirkkoa silmällä. Kirkon sisällä on muotokuva tästä lähetysasemien suojeluspyhimyksestä, Francis Solanosta, Perun lähetysasemien lähetyssaarnaajasta.

vuoden 1906 maanjäristys tuhosi lähetysaseman, mutta se kunnostettiin Historic Landmarks Leaguen kaltaisten ryhmien antaumuksella. California missions perintö elää Mission Solano kuten se tekee muualla tämän historiallisen ketjun.