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Protein Folding

4.7Protein Folding and Associated Diseases

タンパク質は、小胞体(ER)内腔の新生ポリペプチドとしてリボソーム上で合成される。 二次構造および三次構造を決定するタンパク質のアミノ酸配列は、mRNAのヌクレオチド配列によって決定される。 次に、mRNA配列は、DNA配列によって決定される(第2 3−2 5 2 3 2 4 2 5章)。 前述したように、PaulingとAnfinsenの古典的な実験は、適切な位置にある特定の重要なアミノ酸がタンパク質を三次元、機能的、ユニークな立体構造に折り畳むために不可欠であるという概念につながった。 何億もの立体配座の可能性の中で、単一の立体配座形態だけが機能性タンパク質に関連していることは驚くべきことです。 完全に折り畳まれた構造に中間ポリペプチドの折り畳みを指示し、標的化するプロセスは、いくつかの例では、分子シャペロン(シャペロニンとも呼ば

図4-13. タンパク質のフォールディングの経路。 通常の折り畳みは、シャペロンおよび他の要因の助けを借りて起こる。 ポリペプチドの誤折り畳みは、不適切な細胞位置への標的化、または品質管理プロセスの一部としての分解、または凝集につながる可能性がある。 凝集生成物は、しばしばタンパク質分解に耐性であり、アミロイド斑などの凝集物を形成する。

シャペロンは、展開されたポリペプチドセグメントに可逆的に結合し、それらのミスフォールディングおよび早期凝集を防ぐ。 このプロセスには、ATPの加水分解によって提供されるエネルギー消費が含まれる。 Chaper-onesの主要なクラスは熱衝撃蛋白質(hsp)であり、熱衝撃か他の圧力(例えば、遊離基の露出)に応じて原核生物および真核生物の細胞で総合されます。 細胞の様々な細胞小器官に存在する熱ショックシャペロン(HSP-60、HSP-70、およびHSP-90)の多くのクラスがあります。 HSP-70シャペロンにはATPaseドメインとペプチド結合ドメインの二つのドメインが含まれている。 それらは、新生ポリペプチドを安定化させ、また、変性形態のポリペプチドを再形成することができる。 シャペロンのH SP−7 0ファミリーは、種々の種の間で高度の配列相同性を示す(例えば、E.coliおよびヒトH SP−7 0タンパク質は、5 0%の配列相同性を示す)。

別のシャペロン、カルネキシンは、90kDaのCa2+結合タンパク質であり、ERの不可欠な膜リンタンパク質である。 カルネキシンは、グリコシル化を受けた誤って折り畳まれた糖タンパク質と複合体化することにより、新たに合成された糖タンパク質の輸出を監視する(第16章)。 蛋白質が適切な立体配座に折ることができなければシャペロンは破壊で助けます。 折り畳みのプロセスは、イオン環境、補因子、および酵素によっても促進される。 例えば、フォールディングは、正しいジスルフィド結合の形成を触媒するプロテインジスルフィドイソメラーゼと、特定のアミノ酸-プロリンペプチド結合のシス-トランス異性化を触媒するペプチジルプロリルイソメラーゼによって影響される。

タンパク質の折り畳みのいくつかの障害は、タンパク質の凝集と細胞内およびその周囲の沈着の特徴的な病理学的特徴を有することが知ら 蛋白質の沈殿物はアミロイドと呼ばれ、病気はアミロイドーシスとして知られています。 また、コンフォメーション疾患として知られているタンパク質折りたたみ疾患は、タンパク質の一次構造の変化、シャペロンの欠陥、および他のタンパク質の不適切な存在または影響など、多くの異なる病因を有する。 タンパク質折り畳み障害のリストを表4-1に示す; いくつかは以下で説明され、他は後続の章で説明されています。 立体構造タンパク質疾患の一般的ではあるが不変ではない側面は、ポリペプチドの凝集がβ構造で構成されていることである。 これは主にα-ヘリカル構造からβ-構造への移行によるものである。 別の特徴は、凝集体が正常なタンパク質分解に対して耐性であることである。

表4-1に示すように、

となります。 Examples of Protein Folding Diseases*

Disease Mutant protein/protein involved Molecular phenotype
Inability to fold
Cystic fibrosis CFTR Misfolding/altered Hsp70 and calnexin interactions
Marfan syndrome Fibrillin Misfolding
Amyotrophic lateral sclerosis Superoxide dismutase Misfolding
Scurvy Collagen Misfolding
Maple syrup urine disease α-Ketoacid dehydrogenase complex Misassembly/misfolding
Cancer p53 Misfolding/altered Hsp70 interaction
Osteogenesis imperfecta Type I procollagen pro α Misassembly/altered BiP expression
Toxic folds
Scrapie/Creutzfeldt-Jakob/ familial insomnia Prion protein Aggregation
Alzheimer’s disease β-Amyloid Aggregation
Familial amyloidosis Transthyretin/lysozyme Aggregation
Cataracts Crystallins Aggregation
Mislocalization owing to misfolding
Familial hypercholesterolemia LDL receptor Improper trafficking
α1-Antitrypsin deficiency α1-Antitrypsin Improper trafficking
Tay-Sachs disease β-Hexosaminidase Improper trafficking
Retinitis pigmentosa Rhodopsin Improper trafficking
Leprechaunism Insulin receptor Improper trafficking

* Reproduced with permission from P. J. Thomas, B-H. Qu and P. L. Pedersen. Trends in Biochemicals Sciences 20, 456 (1995).

記憶、認知、行動の安定性、および独立した機能の潜行性の進行性の低下を特徴とする認知症症候群は、Alois Alzheimerによって記述され、Alzheimer’s disease(AD)とし 年齢はADの重要な危険因子であり、65歳以上の人の10%、85歳以上の人の約40%に影響を与えます。 特徴的な神経病理学的変化には、海馬および新皮質における関連する神経損失を伴う細胞外神経突起プラークおよび神経内のもつれの形成が含まれる(図4-14)。

図4-14. 神経原線維のもつれ(A)と神経突起プラーク(B)を含むアルツハイマー病患者からの大脳皮質のセクション。 このセクションはBielsehowskyの汚れで処理されました。 (ジョン-M-ハードマンの礼儀。)

細胞外プラークの主要な構成要素はアミロイドβタンパク質(A Β)であり、これは8nmのフィラメントに凝集する。 A βは40または42アミノ酸残基のペプチドであり、β-アミロイド前駆体タンパク質(β APP)として知られている膜貫通糖タンパク質からタンパク質分解性に誘導される。 Β appをA Βに切断する酵素はセクレターゼとして知られている。 2つの主要な観察はAlzheimerの病気の病理学におけるA Βのペプチッドの役割の理解で助けました。 最初は、ダウン症候群の患者がトリソミー21を有することである(すなわち、、21番染色体の代わりに三つ)、A Β沈着を示し、40歳以上でアルツハイマー病の古典的な特徴を発症する。 第二に、β appのいくつかのミスセンス変異は、常染色体優性アルツハイマー病の症例で同定されています。 Β appにおけるこれらの優性変異は、A Β排泄の絶対速度を増加させること(N末端変異)またはa Β42とA Β40の比を増加させること(C末端変異)のいずれか

アルツハイマー病の遺伝性疾患は、すべての症例の1%未満を表す。 A Βペプチドは凝集してβ構造を形成し、フィブリルをもたらす。 A Β42ペプチドは、より多くの神経毒性であり、多くの相互に関連するメカニズムによって毒性作用を生成する。 これらは、酸化的損傷、細胞内Ca2+恒常性の変化、細胞骨格再編成、およびサイトカインによる作用を含む可能性がある。

神経内のもつれは、微小管関連タンパク質タウからなる長い対になった螺旋状のフィラメントの束である。 タウタンパク質の正常な機能は、チューブリンの重合を促進することによってニューロンの微小管を安定化させることである。 通常、タウ蛋白質は溶けます; しかし、それが過度にリン酸化されると、それは不溶性の糸状ポリマーに変わる。 リン酸化/脱リン酸化イベントの調節不全は、特定のキナーゼの活性の強化と特定のホスファターゼの活性の低下に起因している。 プラークはADのために病理学的であるのに対し、もつれは病因学的に異なる神経学的疾患に見られる。 異常な過リン酸化および線維性ポリマーへのタウタンパク質の異常な凝集の障害は、タウパチーとして知られている。 ADに加えてタウパチーの例は、進行性核上麻痺、ピック病、皮質基底変性症、および前部側頭性痴呆である。

β appに加えて、他の二つの遺伝子は、アルツハイマー病の常染色体優性型の早期発症に関与しています。 他の二つの原因遺伝子は14番染色体と1番染色体に位置し、膜貫通タンパク質のプレセニリン1(467アミノ酸残基からなる)とプレセニリン2(448アミノ酸残基からなる)をコードしている。 これらのタンパク質は神経細胞で合成されるが、その機能は知られていない。 但し、presenilinの遺伝子の突然変異はA Β42ペプチッドの余分な生産の原因となります。

散発性のアルツハイマー病は、すべての症例の90%を占め、複雑な疾患であり、長い時間にわたって現れる環境要因と遺伝的形質の両方の複合作用を表 19番染色体上にあるアポリポタンパク質E(apo E)の多型遺伝子の様々な形態は、アルツハイマー病の人でより高い頻度で発生することが見出されている。 Apo E遺伝子には三つの対立遺伝子があり、六つの組み合わせがある。: ε2/ε2,ε3/ε3,ε4/ε4,ε2/ε3,ε2/ε4、ε3/ε4. Apo Eは主にレバーで総合される脂質のキャリア蛋白質です;但しそれはまた星状細胞およびニューロンで総合されます。 リポタンパク質代謝におけるapo Eタンパク質の機能および早期アテローム性動脈硬化症との関係は、第20章で議論されている。

apo Eのいくつかの遺伝子型のうち、二つのapo e β4対立遺伝子の獲得は、アルツハイマー病のリスクを最大八倍に増加させる可能性があります。 Apo E遺伝子の各コピーは、リスクを増加させ、発症をより低い年齢にシフトさせる。 アポE β4タンパク質がもつれやプラークの形成に関与する生化学的メカニズムは不明である。 タウ蛋白質との相互作用,A Βペプチドの生成,クリアランスなどのいくつかのメカニズムが示唆されている。

アルツハイマー病の薬理学的治療は、アセチルコリンエステラーゼ阻害剤(例えば、タクリン、ドネペジル)を投与することによってコリン作動性欠損 アルツハイマー病の女性のエストロゲン療法は改善された認識性能と関連付けられました。 エストロゲンの有利な効果はコリン作動性およびneurotrophic行為が原因であるかもしれません。 他の治療戦略は、神経毒性ペプチドの形成を阻害または減少させることに向けられている。 さらに、凝集したペプチドを選択的に消化する薬物が有用であることが判明し得る。 プラーク産生マウスに投与されたAPペプチドを含む実験的なワクチンは、若いマウスではプラーク形成が少なく、古いマウスではプラークが消失する。 マウスにおけるプラーク形成の変化は、記憶および学習能力の保存と関連していた。 ワクチン接種は、実験動物における自己免疫応答または毒性反応を誘発しなかった。 したがって、これらの研究は、ヒトワクチンの開発のための刺激を提供してきた。

アルツハイマー病の患者を評価する際には、重要な生化学的および臨床的パラメータを決定することによって、認知症の他の治療可能な原因を排除 認知症を引き起こす治療可能で比較的一般的な異常のいくつかには、薬物乱用、電解質の不均衡、甲状腺の異常、およびビタミンB12欠乏症が含まれ; あまり一般的でない異常は、腫瘍、脳卒中、およびウェルニッケ脳症である。

トランスチレチンアミロイドーシス(家族性アミロイドポリニューロパシーとも呼ばれる)は、末梢神経障害を特徴とする常染色体優性症候群である。 この疾患は、これまでにトランスチレチンの遺伝子で同定された五つの変異の一つに起因する。 TransthyretinはまたpH8.6で標準的な電気泳動のアルブミンに先んじて移住するので(アルブミンと構造関係がないが)prealbuminと呼ばれます。 Transthyretinは肝臓で合成され、20-40mg/dLの濃度を有する正常な血漿タンパク質である。 それはチロキシンおよびレチノールの結合蛋白質を運びます(第38章)。 Transthyretinの濃度は栄養失調で有意に減少し、血漿レベルは栄養失調の障害の診断である(第17章)。

トランスチレチンの遺伝子は18番染色体上に存在し、構成的に発現される。 トランスチレチンの一次構造は、127個のアミノ酸残基と、平行平面上に反平行立体配座に配置された八つのβシート構造からなる(図4-15)。

図4-15. Transthyretinの構造。 この分子は二つの平行平面に配置された八つの反平行β鎖(A-H)を含む。 Transthyretinの循環形態は四量体である。 Transthyretin遺伝子のいくつかの変異はアミロイドーシスと関連しており,この疾患を引き起こすアミノ酸変化のうち八つが示唆されている。 血しょうでは、transthyretinは同一の単量体で構成される四量体です。 変異により,トランスチレチンの単量体展開中間体が不溶性β-アミロイド線維形成に凝集することが明らかになった。

異常な性質のタンパク質折り畳み障害は、プリオン(PrP)と呼ばれるタンパク質を含む透過性海綿状脳症(TSE)のグループを説明するこ プリオン病として知られているこれらの疾患は、すべて動物およびヒトの脳におけるアミロイド沈着を特徴とする。 臨床的特徴には、運動制御の喪失、認知症、麻痺、および消耗を伴う神経症状が含まれる。 プリオン病の潜伏期間は、動物では数ヶ月、人間では数年です。 治療法は、これらの疾患のいずれかのために利用できません。 TSEはいくつかの種の動物およびヒトに発生し、動物モデルはこれらの疾患の分子基盤を解読する上で不可欠であった。 動物および人間で起こるプリオンの病気の例は次のとおりです:

Cats : transimissible feline encephalopathy
Cows : bovine spongiform encephalopathy (BSE)
Mink : transmissible mink encephalopathy
Mule deer and elk: : chronic wasting disease
Sheep : scrapie
Humans : クロイツフェルト-ヤコブ病(CJD)、Kuru、致命的な家族性不眠症症候群、およびGerstmann-Straussler-Schenker病

TSEsは、遺伝性、感染性、散発性のプレゼンテーショ さらに、遺伝性疾患も感染性であり得る。 CJDは、遺伝性常染色体優性障害として、および伝達可能な形態の両方で起こる。 “蛋白質だけ”仮説では、異常なプリオン蛋白質は、外部ソースから導入されるか、または変異したプリオン蛋白質の遺伝子によって作り出されて、正常な蛋白質の折畳みに影響を与え、異常なプリオン蛋白質の形成の方にプリオン蛋白質の折畳みを移します。 機能不明の正常プリオンタンパク質の異常型への変換には,共有結合修飾ではなく配座変化が関与する。 異常プリオンタンパク質は,他の細胞に伝播して伝達することができる異常なアミロイドジェネリック豊富なβ構造タンパク質に向かって正常な細胞プリオンタンパク質を誘導する種子として機能する。 アミロイドを形成するプリオンタンパク質の凝集形態は、タンパク質分解に耐性である。

天然に存在するプロテアーゼ感受性プリオンタンパク質のプロテアーゼ耐性型への変換は、二つのタンパク質を混合することによってin vitroで起こる。 しかし、これらのプロテアーゼ耐性プリオンタンパク質は感染性ではない。 したがって、プリオン感染の”タンパク質のみ”仮説では、abherrant立体配座の獲得は、感染性の伝播のために十分ではありません。 しかし,酵母(Saccharomycescerevisiae)系では,リポソーム融合によって導入された酵母蛋白質の異常プリオン形態は,凝集体として蓄積する正常蛋白質の自己増殖立体配座変化を播種することができる。 凝集体は、異常な表現型の伝播とともに娘酵母細胞に伝達される。

最近、牛のプリオン病が種の障壁を越えて人間に感染する可能性があることを示すことによって、深刻な公衆衛生上の問題が生じています。 これは、牛がスクレイピーに感染した羊から作られた食事を与えられたときに発生しました。 牛はBSE(一般に「狂牛病」と呼ばれる)を発症した。 その後、人々がプリオン汚染牛肉を消費したとき、主に英国では少数がCJD(vCJD)の変種を開発しました。 CJDの変形の形態は受継がれたか、または散発的CJDから期待されるより大いに若い人口で起こるプリオンの病気の独特な形態です。 BSEおよびvCJDは両方とも、ヒトvCJDとウシBSEとの間の病因的関連を示唆する多くの類似した病理学的特徴を共有する。

腫瘍抑制タンパク質p53は、病理学的効果、この場合の癌(pはタンパク質であり、53はおおよその分子量53,000である)につながる可能性のあるタンパク質 P53のための遺伝子は染色体17(17p)の短い腕にあり、393アミノ酸のリン蛋白質のためにコードします。 多くの癌でp53遺伝子は突然変異し、正常なp53蛋白質の欠乏は人間癌の40%多くの開発につながりました。

正常なp53は腫瘍抑制因子として機能し、通常、細胞増殖、DNA修復、およびアポトーシス(プログラムされた細胞死)を制御するために必要ないくつかの遺伝子の調節に関与する転写因子である。 正常なp53は四量体であり、配列特異的な方法でDNAに結合する。 P53調節遺伝子の一つは、サイクリンキナーゼに結合することによって細胞周期を妨害するp21として知られているタンパク質を産生する。 P53によって調節される他の遺伝子は、MDM2およびBAXである。 前者の遺伝子は、調節フィードバック機構の一部として機能することによってp53の作用を阻害するタンパク質をコードする。 BAX遺伝子によって作られたタンパク質は、p53誘導アポトーシスにおいて役割を果たすと考えられている。

p53遺伝子のほとんどの突然変異は、DNA結合ドメイン内のアミノ酸置換を含む体細胞ミスセンス変異である。

P53遺伝子の変異は、DNA結合ドメ P53の変異型は、異常なコンフォメーションとDNAに結合することができない、または彼らはあまり安定していないとミスフォールドタンパク質です。 まれな障害Li-Fraumeni症候群(常染色体優性形質)を有する個体は、1つの変異p53遺伝子および1つの正常なp53遺伝子を有する。 これらの個体は、白血病、乳癌、軟部肉腫、脳腫瘍、および骨肉腫などの多くの癌に対する感受性を増加させている。

遺伝子治療による腫瘍細胞への正常なp53遺伝子の導入(第23章)が癌の治療に有益な効果を有するかどうかを調べるための臨床試験が進行中で P53遺伝子療法の早い結果はapoptosisの誘発によって腫瘍を縮めるかもしれないことを示します。