av Dr. Ananya Mandal, MDReviewed av Sally Robertson, B.Sc.

oligonukleotider är korta nukleinsyrapolymerer som används i forskning, genetisk testning och kriminalteknik.

oligonukleotider består vanligtvis av 13 till 25 nukleotider och är utformade för att hybridisera specifikt till DNA-eller RNA-sekvenser. Fastfas klinisk syntes används för att tillverka dessa små bitar av nukleinsyra för användning i polymeraskedjereaktion (PCR), DNA-sekvensering, bibliotekskonstruktion och artificiell gensyntes.

termen oligonukleotid härrör från den grekiska ”oligo”, vilket betyder få eller små. Längden på oligonukleotiden betecknas vanligtvis med termen”mer”, som är grekisk för ” del.”

oligonukleotider används som sonder för att detektera specifika sekvenser som är komplementära till oligonukleotiderna. När en viss sekvens behöver detekteras syntetiseras en komplementär oligonukleotid i laboratoriet. Det binds sedan till en fluorescerande markör och får binda till det specifika segmentet av RNA eller DNA som det utformades för att detektera. Att använda molekylerna som sonder för detektion är en av de viktigaste funktionerna hos oligonukleotider.

exempel på procedurer som använder oligonukleotider på detta sätt inkluderar DNA-mikroarrayer, Southern blot-analys, aso-analys, fluorescerande in situ hybridisering (fisk).

oligonukleotider som består av 2′-deoxiribonukleotider är molekylerna som används i polymeraskedjereaktion (PCR). Dessa kallas primers och används för att massivt förstärka en liten mängd DNA. Primern binder till den specifika DNA-sekvensen och DNA-polymeras används för att förlänga oligonukleotiden och replikera den komplementära strängen.

Vidare läsning

• Alla oligonukleotider innehåll
• oligonukleotid syntes

citat