As with all surgicions, the HoLEP procedure is not without risks and side effects. Os efeitos secundários mais comuns são queimadura ligeira temporária, frequência de micção e urgência. O Dr. Walsh pode prescrever antibióticos se necessário ou se ocorrer uma infecção. Ocasionalmente, os homens experimentam incontinência urinária, que normalmente se resolve em seis semanas e pode ser melhorada com exercícios no chão pélvico (ensinados antes da cirurgia). Uma almofada pode ser usada se necessário, mas a necessidade de almofadas após três meses é rara (menos de dois por cento dos pacientes que passam por este procedimento).alguns doentes podem não conseguir urinar após o procedimento devido a inchaço temporário e necessitarão de um cateter até que o inchaço se resolva e a bexiga regresse à sua função normal. Este cateter temporário é geralmente removido com sucesso apenas um dia após a cirurgia. Tal como referido acima, a hemorragia intermitente pode continuar durante várias semanas após o procedimento. Raramente, os doentes podem sentir dificuldade súbita em urinar, hemorragias graves ou passagem de coágulos que podem requerer hospitalização. Muito raramente, pode ser necessário repetir o tratamento ou cirurgia adicional se ocorrer um crescimento da próstata, incontinência persistente, fragmentos de tecido retidos na bexiga e/ou perfuração da bexiga.

é possível que os doentes experimentem erecções mais fracas ou, raramente, sem erecções posteriores, mas a remoção da próstata não deve afectar negativamente a sua capacidade de ter uma erecção se estiver a ter erecções normais antes do procedimento. Após a cirurgia da próstata, é comum os homens não serem mais capazes de ejacular sémen durante o orgasmo, porque o sémen tenderá a viajar de volta para a bexiga. Esta mudança não é desconfortável ou prejudicial, mas pode ter um impacto significativo na fertilidade, se você espera ter filhos no futuro. A maioria dos homens diz que os orgasmos continuam a ser agradáveis.