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Understanding Predictions: What is R-Naught?

7 de fevereiro de 2020

Por Anders Gunderson’e Liana Woskie, HGHI

Em um surto, a questão de como rapidamente um novo patógeno se espalha a partir de um caso, para muitos é uma peça essencial do quebra-cabeça que os cientistas tentam colocar juntos. Para responder a esta pergunta, os especialistas utilizam modelos que fornecem estimativas, extraindo de diferentes fontes de informação. O resultado deste complexo processo de modelagem é um número básico de reprodução, ou R0, que nos diz, em média, quantas pessoas uma pessoa infectada pode infectar.o que é R-naught?
R-naught (R0) é um valor que pode ser calculado para doenças transmissíveis. Representa, em média, o número de pessoas a quem se pode esperar que uma única pessoa infectada transmita essa doença. Em outras palavras, é um cálculo da “planificabilidade” média de uma doença infecciosa.porque é que é útil?
R0 provides valuable insight into the potential spread of a disease that local, state, and national governments, as well as public health authorities can use to factor into their decision making to best control the . Além disso, uma vez que pode ser calculado para várias doenças, nos permite contextualizar um surto com aqueles que já vimos anteriormente, como SARS, MERS, Ebola, AIDS, gripe sazonal, 2009 pandemia de gripe H1N1 etc.como é calculado?existem três fatores principais utilizados para calcular R0. São o período infeccioso da doença, o modo de transmissão e a taxa de contato. Vamos mergulhar um pouco mais fundo em cada um.

período infeccioso
esta é a duração que uma pessoa infectada é capaz de transmitir essa infecção para outro humano — quanto tempo uma pessoa com a doença é contagiosa. Períodos infecciosos mais longos significam valores R0 mais elevados.

modo de transmissão
É assim que a doença se espalha. Infecções aerotransportadas, como a gripe, vai se espalhar mais rapidamente do que aqueles que exigem contato físico para ser transmitida, como HIV ou Ebola. Portanto, as infecções transmitidas pelo ar tendem a ter valores R0 mais elevados.

ontact Rate
this refers to how many people a person with the disease can be expected to come into contact with. Esta variável não é específica a uma doença como as duas primeiras. Pelo contrário, é impactada por inúmeros factores, incluindo medidas de localização e de saúde pública em vigor, tais como quarentena ou proibição de viajar. Este factor é consideravelmente modificável.esta variável é relativamente fixa para uma determinada infecção — mas pode variar um pouco de pessoa para pessoa. Por exemplo, uma pessoa mais jovem e saudável pode ser infecciosa por menos tempo do que uma pessoa mais velha com condições de saúde subjacentes. No caso de 2019-nCoV, temos estimativas para o período infeccioso com base em casos iniciais, mas esses valores permanecem estimativas. Isto também levanta o ponto de que R0 é uma média, e os valores a partir dos quais é calculado, incluindo o período infeccioso, também são médias, o que significa que pode haver uma variabilidade considerável. Por exemplo, quando existem superspreaders com um R0 alto, isso será compensado pela maioria da população realmente ter R0 baixo.

modo de transmissão
esta variável também é relativamente fixa para uma determinada infecção, mas da mesma forma com o período infeccioso, não temos certeza exatamente como 2019-nCoV é espalhado. Vários estudos recentes sugerem que grandes gotículas no ar, como o que pode ser produzido a partir da tosse de uma pessoa infectada, pode transmitir a doença, mas há alguma confusão sobre se as pessoas com 2019-nCoV, são infecciosas antes de desenvolver os sintomas. Por exemplo, um artigo publicado no New England Journal of Medicine em 30 de janeiro de que as provas documentadas para a transmissão assintomática de 2019-nCoV foram agora relatadas como baseadas em informações erradas. Ainda estamos a aprender sobre este vírus, e quaisquer valores R0 produzidos até agora só podem ser calculados com base na informação em questão.

Contact Rate
This is where things start to get a little more complicated. A taxa de contato de um paciente infectado pode variar loucamente de pessoa para pessoa e depende de inúmeras variáveis, incluindo Geografia, padrões de viagem, quarentena ou proibições de viagem, e a capacidade de um sistema de saúde para identificar e isolar eficazmente os pacientes infectados para citar alguns. Este valor, ao contrário do período infeccioso ou modo de transmissão, é altamente modificável. Taxas de contacto mais elevadas significam valores de R0 mais elevados, mas todos estes factores têm de ser estimados com base no contexto do surto. No caso de 2019-nCoV, um artigo recente da Lancet estimou os volumes diários de viagens e contabilizou as intervenções de saúde pública, como as quarantinas, para produzir as suas estimativas.

R0 of 2019-nCoV in Context

R0 is often graphed alongside a disody’s mortality rate, such as in this NYT interactive (scroll down) or this visualization. Esta é uma maneira útil para ter uma idéia tanto da “planificabilidade” de uma doença e como é letal, em comparação com os outros, mas não é sem problemas. Nesta fase, a taxa de mortalidade de 2019-nCoV não pode ser calculada com precisão porque não conhecemos o número real de casos totais – é, portanto, uma estimativa baseada no que sabemos até agora, muito parecido com R0. Assim, esses gráficos fornecem o contexto para onde 2019-nCoV significa comparada a outras doenças infecciosas, mas devemos notar que, simplesmente, vendo que 2019-nCoV não parece ser tão fatal ou barrar, não significa que a realidade do surto vai jogar fora de forma.o que significa tudo isto?
isso destaca a complexidade inerente e variabilidade de surtos. Os valores de R0 podem ser úteis para avaliar a gravidade do surto, mas um alto valor de R0 não garante uma propagação mundial, ou uma pandemia. É um cálculo de um valor médio que é baseado em estimativas de médias. Quando os valores R0 iniciais são produzidos, devem ser distribuídos com cuidado e orientação sobre como interpretá-los. Vimos o público alarmar-se em torno das estimativas R0 com este surto actual, que é exactamente o que devemos procurar evitar.