Az Egyház jelei azok a dolgok, amelyekkel az igazi egyház elismerhető a protestáns teológiában. Általában három jelet sorolnak fel: a szó prédikálását, a szentségek kezelését és az egyházi fegyelmet. A Belgic Vallomás szentel egy fejezetet (29. Cikk), hogy a “Jelöli az Igaz Egyház” majd azokat egy listán megjeleníti a következőképpen:

Az igaz egyház is lehet elismert, ha a következő jeleket: Az egyház végez a tiszta prédikálni az evangéliumot; ettől használata a tiszta közigazgatás, a szentségek, mint Krisztus bevezette őket; gyakorlatok egyházi fegyelem, a hibák kijavítása. Röviden: Isten tiszta szava szerint irányítja magát, elutasítva minden vele ellentétes dolgot, és Jézus Krisztust tartja az egyetlen fejnek. Ezekkel a jelekkel biztos lehet abban, hogy felismerjük az igaz egyházat-és senki sem választható el tőle.

Louis Berkhof megjegyzi, hogy a református teológusok különböztek a jelek számától: Theodore Beza csak egyről beszélt (prédikálás), Kálvin János és Heinrich Bullinger kettőről (prédikálás és szentségek), míg Peter Martyr és Zacharias Ursinus három prédikációról, szentségről és fegyelemről beszélt. Mindazonáltal Edmund Clowney rámutat arra, hogy Calvin ” magában foglalta a fegyelmet a szentségek megfelelő betartásában.”Albert Mohler az egyházi fegyelmet az egyház “hiányzó jelének” nevezi.