유전자 온톨로지기충
유전자 OntologyEdit
유전자 온톨로지(가)제공합 시스템을 위한 계층적으로 분류하는 유전자 또는 유전자제품으로 조직에서는 그래프는 구조(또는 온톨로지). 용어는 세 가지 범주로 그룹입니다: 분자 기능(을 설명하는 분자 활동의 유전자),생물학적 과정(을 설명하는 더 큰 세포 또는 생리적인 역할을 수행된 유전자에 의해 조정되는 다른 유전자)와 세포의 구성 요소(을 설명하는 위치에서 세포 유전자 제품을 시행하는 기능). 각 유전자는 여러 용어로 설명(주석 처리)할 수 있습니다. GO 는 인간,모델 생물 및 기타 다양한 종의 유전자를 분류하는 데 적극적으로 사용됩니다.
를 사용하여 이동이 가능하여 검색할 수의 약관을 설명하는 데 사용되는 모든 유전자,또는 반대로 주어진 기간에 반납하트 유전자의 주석을 추가하는 용어입니다. 후자의 쿼리의 경우,GO 의 계층 적 시스템이 완전한 결과를 제공하기 위해 사용됩니다. 예를 들어,핵에 대한 GO 용어에 대한 쿼리는”핵막”이라는 용어에 주석이 달린 유전자를 반환해야합니다.
해석은 고 처리량 dataEdit
특정 유형의 높은 처리량 실험(예:RNA seq)세트를 반환되는 유전자의 위 또는 아래에 표현했다. 이동하는 데 사용될 수 있는 기능적으로 프로파일이 설정의 유전자를 결정하는 조건보다 더 자주 나타납가 우연히 발생하기를 기대하는 것을 검토할 때에는 설정의 조건석을 입력 유전자입니다. 예를 들어,실험은 건강한 세포 대 암 세포의 유전자 발현을 비교할 수 있습니다. 기능적 프로파일 링을 사용하여 암 상태와 관련된 기본 세포 메커니즘을 밝힐 수 있습니다. 이것은 또한이라는 용어는 농축 또는 용어 overrepresentation 으로,우리는지 테스트 가 기간은 통계적으로 농축을 위해 지정된 유전자가 있습니다.
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